Resource

Id summary/johansen2025Crossspecies/rna_expression_metadata/HMBA-10xMultiome-BG-Aligned/20260415/cell_metadatacontent_copy
Type data_frame
Version 0
Summary
Description
Labels
  • assay: 10x_Multiome
  • brain_region: basal ganglia
  • dataset: johansen2025Crossspecies
  • directory: HMBA-10xMultiome-BG-Aligned
  • release_date: 20260415
  • sequencing_platform: Illumina
  • vendor: 10x_Genomics
Columns count unique top freq mean std min 25% 50% 75% max
cell_label 1896133 1896133 AAACAGCCAAATGCCC-2362_A05 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
cell_barcode 1896133 680274 AGCCAGTGTGACATAT 14 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
donor_label 1896133 22 CJ23.56.003 178386 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
barcoded_cell_sample_label 1896133 417 936_A03 15121 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
library_label 1896133 417 L8XR_211118_02_A04 15121 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
alignment_job_id 1896133.0 303.0 250114.0 91541.0 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
doublet_score 1583100.0 NaN NaN NaN 0.048411 0.069774 0.0 0.0 0.02 0.067568 0.85
umi_count 1583100.0 NaN NaN NaN 17793.329936 16871.869927 2000.0 5567.0 12044.0 24204.0 99999.0
feature_matrix_label 1896133 1 HMBA-10xMultiome-BG-Aligned 1896133 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
dataset_label 1896133 1 HMBA-10xMultiome-BG-Aligned 1896133 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
abc_sample_id 1896133 1896133 38447b19-a5dc-4eca-9021-56ae191e8809 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN

Files

Filename Size md5
cell_metadata.csv.gz 69.58 MB c65f5709f2774081c2bbcfebc38cb581
genomic_resource.yaml 744.0 B de07e3be9386e3982358555a784c1dab
statistics/