Resource
| Id | summary/johansen2025Crossspecies/rna_expression_metadata/HMBA-10xMultiome-BG/20250630/cell_metadata |
|---|---|
| Type | data_frame |
| Version | 0 |
| Summary |
Meta data file for expression subset HMBA-10xMultiome-BG
|
| Description | |
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cell_label | 2936782 | 2936782 | AAACAGCCAAATGCCC-2362_A05 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| cell_barcode | 2936782 | 722176 | GCCCGTTGTTACTTCA | 17 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| donor_label | 2936782 | 22 | H24.30.004 | 329125 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| barcoded_cell_sample_label | 2936782 | 417 | 994_C03 | 20000 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| library_label | 2936782 | 417 | L8XR_220106_02_B05 | 20000 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| alignment_job_id | 2936782.0 | 303.0 | 250114.0 | 120220.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| doublet_score | 2522207.0 | NaN | NaN | NaN | 0.090221 | 0.157097 | 0.0 | 0.0 | 0.025641 | 0.097561 | 0.98 |
| umi_count | 2522207.0 | NaN | NaN | NaN | 17266.39746 | 23793.927691 | 5.0 | 3167.0 | 9111.0 | 22906.0 | 2000458.0 |
| feature_matrix_label | 2936782 | 3 | HMBA-10xMultiome-BG-Human | 1683105 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| dataset_label | 2936782 | 1 | HMBA-10xMultiome-BG | 2936782 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| abc_sample_id | 1898081 | 1898081 | 38447b19-a5dc-4eca-9021-56ae191e8809 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| cell_metadata.csv.gz | 84.7 MB | e762007a2c284aaab57f275ae1f78dce |
| genomic_resource.yaml | 728.0 B | 9587dda248bfe19b302b21997608445f |
| statistics/ |