Resource

Id summary/johansen2025Crossspecies/rna_expression_metadata/HMBA-BG-taxonomy-CCN20250428/20250630/cluster_annotation_termcontent_copy
Type data_frame
Version 0
Summary
Description
Labels
  • assay: 10x_Multiome
  • brain_region: basal ganglia
  • dataset: johansen2025Crossspecies
  • directory: HMBA-BG-taxonomy-CCN20250428
  • release_date: 20250630
  • sequencing_platform: Illumina
  • vendor: 10x_Genomics
Columns count unique top freq mean std min 25% 50% 75% max
label 1548 1548 CS20250428_NEIGH_0001 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
name 1548 1534 F M Glut 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
cluster_annotation_term_set_label 1548 5 CCN20250428_LEVEL_4 1435 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
cluster_annotation_term_set_name 1548 5 Cluster 1435 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
color_hex_triplet 1548 1528 #a8afa5 4 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
term_order 1548.0 NaN NaN NaN 666.396641 437.881179 0.0 273.75 660.5 1047.25 1434.0
term_set_order 1548.0 NaN NaN NaN 3.880491 0.478963 0.0 4.0 4.0 4.0 4.0
parent_term_label 1544 113 CS20250428_GROUP_0064 86 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
parent_term_name 1544 99 VTR-HTH Glut 86 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
parent_term_set_label 1544 4 CCN20250428_LEVEL_3 1435 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN

Files

Filename Size md5
cluster_annotation_term.csv.gz 24.48 KB 30b1cc82a97d4e8d89115ed1951af69f
genomic_resource.yaml 756.0 B 3a75533732cf212a9be3e9e2e784d8df
statistics/