Resource
| Id | summary/johansen2025Crossspecies/rna_expression_metadata/HMBA-MERSCOPE-H22.30.001-BG/20260228/mmc_results |
|---|---|
| Type | data_frame |
| Version | 0 |
| Summary |
Meta data file for expression subset HMBA-MERSCOPE-H22.30.001-BG
|
| Description | |
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cell_label | 5431560 | 5431560 | 1324989690_1-20250227 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood | 5431560 | 5 | Nonneuron | 4224819 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood_bootstrapping_probability | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.987188 | 0.051303 | 0.21 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Neighborhood_correlation_coefficient | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.391258 | 0.155403 | -0.0265 | 0.2679 | 0.4055 | 0.5141 | 0.8249 |
| Class | 5431560 | 13 | OPC-Oligo | 2211725 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Class_bootstrapping_probability | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.975606 | 0.071645 | 0.16 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Class_correlation_coefficient | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.391522 | 0.155119 | -0.0265 | 0.2683 | 0.4055 | 0.5141 | 0.8249 |
| Subclass | 5431560 | 37 | Oligodendrocyte | 1912203 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Subclass_bootstrapping_probability | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.958781 | 0.094968 | 0.16 | 0.97 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Subclass_correlation_coefficient | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.391616 | 0.155048 | -0.0264 | 0.2686 | 0.4056 | 0.5141 | 0.8249 |
| Group | 5431560 | 61 | Oligo OPALIN | 1011372 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Group_bootstrapping_probability | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.930565 | 0.119549 | 0.16 | 0.91 | 0.99 | 1.0 | 1.0 |
| Group_correlation_coefficient | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.391749 | 0.154951 | -0.0264 | 0.2688 | 0.4057 | 0.5142 | 0.8249 |
| cluster_id | 5431560 | 497 | Human-1 | 950009 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| cluster_id_bootstrapping_probability | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.870751 | 0.153832 | 0.16 | 0.8 | 0.93 | 1.0 | 1.0 |
| cluster_id_correlation_coefficient | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.391975 | 0.154829 | -0.0264 | 0.2694 | 0.4059 | 0.5142 | 0.8249 |
| hierarchy_consistent | 5431560 | 2 | True | 5405055 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood_entropy | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.036773 | 0.117694 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.513465 |
| Class_entropy | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.071999 | 0.173535 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.94117 |
| Subclass_entropy | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.117668 | 0.224527 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.153838 | 2.071734 |
| Group_entropy | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.191647 | 0.271302 | 0.0 | 0.0 | 0.056002 | 0.325083 | 2.109503 |
| cluster_id_entropy | 5431560.0 | NaN | NaN | NaN | 0.360718 | 0.355369 | 0.0 | 0.0 | 0.268556 | 0.603569 | 2.494091 |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| genomic_resource.yaml | 742.0 B | 33d520f4bafb46633df6c2c36b92515b |
| mmc_results.csv.gz | 169.58 MB | 8fc0198c50c167902e87aa7a48beb0a9 |
| statistics/ |