Resource

Id	summary/johansen2025Crossspecies/rna_expression_metadata/HMBA-MERSCOPE-QM23.50.001-BG/20250630/cell_metadatacontent_copy
Type	data_frame
Version	0
Summary
Description
Labels	assay: 10x_Multiome brain_region: basal ganglia dataset: johansen2025Crossspecies directory: HMBA-MERSCOPE-QM23.50.001-BG release_date: 20250630 sequencing_platform: Illumina vendor: 10x_Genomics

Columns	count	unique	top	freq	mean	std	min	25%	50%	75%	max
cell_label	3255402	3255402	1291813781_1-20250227	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
brain_section_label	3255402	86	QM23.50.001.CX.44.03.05.02	109664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
brain_section_barcode	3255402.0	NaN	NaN	NaN	1293040558.791512	11551278.995842	1291809799.0	1291812310.0	1291813811.0	1291815483.0	1401811732.0
segmentation_job_id	3255402	1	sis_cellpose_v1	3255402	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
x_experiment	3255402.0	NaN	NaN	NaN	5399.788851	2413.407465	-114.20748	3517.79055	5249.155	7162.7225	13097.322
y_experiment	3255402.0	NaN	NaN	NaN	5663.862138	2647.906527	-142.11192	3602.907175	5532.7925	7611.03765	13206.05
qc_pass	3255402	2	True	3164713	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
dataset_label	3255402	1	HMBA-MERSCOPE-QM23.50.001-BG	3255402	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
feature_matrix_label	3255402	1	MERSCOPE-QM23.50.001-BG	3255402	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
abc_sample_id	3164713	3164713	a07ba25c-83d8-49b7-b5f7-0fbc1492661a	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN

Files