Resource
| Id | summary/johansen2025Crossspecies/rna_expression_metadata/HMBA-Macaque-PatchSeq/20260228/mmc_results |
|---|---|
| Type | data_frame |
| Version | 0 |
| Summary |
Meta data file for expression subset HMBA-Macaque-PatchSeq
|
| Description | |
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cell_label | 717 | 717 | QN22.26.002.14.05.04 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood_label | 717 | 1 | CS20250428_NEIGH_0002 | 717 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood_name | 717 | 1 | Subpallium GABA | 717 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood_bootstrapping_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.999079 | 0.011086 | 0.81 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Neighborhood_aggregate_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.999079 | 0.011086 | 0.81 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Neighborhood_correlation_coefficient | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.674507 | 0.090813 | 0.3155 | 0.6297 | 0.6951 | 0.7398 | 0.8288 |
| Class_label | 717 | 2 | CS20250428_CLASS_0003 | 564 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Class_name | 717 | 2 | CN LGE GABA | 564 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Class_bootstrapping_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.99212 | 0.046632 | 0.51 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Class_aggregate_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.991405 | 0.050185 | 0.4452 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Class_correlation_coefficient | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.650984 | 0.095507 | 0.3104 | 0.6006 | 0.6711 | 0.7215 | 0.8109 |
| Subclass_label | 717 | 8 | CS20250428_SUBCL_0029 | 262 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Subclass_name | 717 | 8 | STR D2 MSN | 262 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Subclass_bootstrapping_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.989024 | 0.054333 | 0.51 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Subclass_aggregate_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.980991 | 0.076857 | 0.4452 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Subclass_correlation_coefficient | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.58474 | 0.105257 | 0.2437 | 0.5171 | 0.5987 | 0.6634 | 0.8028 |
| Group_label | 717 | 17 | CS20250428_GROUP_0049 | 113 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Group_name | 717 | 17 | STRd D1 Matrix MSN | 113 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Group_bootstrapping_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.937992 | 0.126809 | 0.44 | 0.96 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Group_aggregate_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.919874 | 0.143807 | 0.4189 | 0.91 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Group_correlation_coefficient | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.533447 | 0.106936 | 0.3208 | 0.4542 | 0.5325 | 0.6093 | 0.7962 |
| Cluster_label | 717 | 79 | CS20250428_CLUST_0892 | 61 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| cluster_alias | 717 | 79 | Macaque-251 | 61 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Cluster_bootstrapping_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.848103 | 0.181368 | 0.25 | 0.72 | 0.95 | 1.0 | 1.0 |
| Cluster_aggregate_probability | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.783254 | 0.216408 | 0.1676 | 0.6 | 0.86 | 0.99 | 1.0 |
| Cluster_correlation_coefficient | 717.0 | NaN | NaN | NaN | 0.417715 | 0.103462 | 0.0905 | 0.3492 | 0.4218 | 0.4894 | 0.7282 |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| genomic_resource.yaml | 730.0 B | 375376888ac09640da5d8f0f6bcb9b4a |
| mmc_results.csv.gz | 23.87 KB | c0aa71df3d9d74dfa690b7e2680ebfa0 |
| statistics/ |