Resource

Id	summary/johansen2025Crossspecies/rna_expression_metadata/HMBA-Xenium-CJ23.56.004-BG/20250630/cell_metadatacontent_copy
Type	data_frame
Version	0
Summary
Description
Labels	assay: 10x_Multiome brain_region: basal ganglia dataset: johansen2025Crossspecies directory: HMBA-Xenium-CJ23.56.004-BG release_date: 20250630 sequencing_platform: Illumina vendor: 10x_Genomics

Columns	count	unique	top	freq	mean	std	min	25%	50%	75%	max
cell_label	1355089	1355089	1382042951_abmkfncc-1-20250227	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
brain_section_label	1355089	46	CJ23.56.004.CX.43.01.07	63164	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
brain_section_barcode	1355089.0	NaN	NaN	NaN	1384448198.067081	2432234.177837	1382033286.0	1382036910.0	1386591529.0	1386593056.0	1388175626.0
segmentation_job_id	1355089	1	xenium_cell_segmentation_kit_v1	1355089	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
x_experiment	1355089.0	NaN	NaN	NaN	5971.997096	1836.412258	997.65741	4600.959473	5946.688477	7385.81543	11437.780273
y_experiment	1355089.0	NaN	NaN	NaN	8421.842501	2310.754186	2071.437256	6631.524902	8352.853516	10147.47168	14616.790039
qc_pass	1355089	2	True	1299927	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
dataset_label	1355089	1	HMBA-Xenium-CJ23.56.004-BG	1355089	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
feature_matrix_label	1355089	1	Xenium-CJ23.56.004-BG	1355089	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
abc_sample_id	1299927	1299927	c8c08d8c-5147-4d03-b6f4-ca7bf4d0b8d1	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN

Files