Resource
| Id | summary/johansen2025Crossspecies/rna_expression_metadata/HMBA-Xenium-CJ23.56.004-BG/20250630/mmc_results |
|---|---|
| Type | data_frame |
| Version | 0 |
| Summary |
Meta data file for expression subset HMBA-Xenium-CJ23.56.004-BG
|
| Description | |
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cell_label | 1355089 | 1355089 | 1382042951_abmkfncc-1-20250227 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| hierarchy_consistent | 1355089 | 2 | True | 1347949 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood_label | 1355089 | 5 | Nonneuron | 763982 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood_name | 1355089 | 5 | Nonneuron | 763982 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood_bootstrapping_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.991495 | 0.049318 | 0.17 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Neighborhood_aggregate_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.991495 | 0.049318 | 0.17 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Neighborhood_correlation_coefficient | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.534057 | 0.149105 | -0.0329 | 0.4338 | 0.5431 | 0.6506 | 0.8607 |
| Class_label | 1355089 | 13 | CN LGE GABA | 486502 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Class_name | 1355089 | 13 | CN LGE GABA | 486502 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Class_bootstrapping_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.985427 | 0.064484 | 0.16 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Class_aggregate_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.985427 | 0.064484 | 0.16 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Class_correlation_coefficient | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.534078 | 0.149065 | -0.0336 | 0.4338 | 0.5431 | 0.6506 | 0.8607 |
| Subclass_label | 1355089 | 35 | Oligodendrocyte | 307719 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Subclass_name | 1355089 | 35 | Oligodendrocyte | 307719 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Subclass_bootstrapping_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.975301 | 0.081736 | 0.16 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Subclass_aggregate_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.975301 | 0.081736 | 0.16 | 1.0 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Subclass_correlation_coefficient | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.534095 | 0.149032 | -0.0336 | 0.4339 | 0.5431 | 0.6506 | 0.8607 |
| Group_label | 1355089 | 57 | Oligo OPALIN | 218834 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Group_name | 1355089 | 57 | Oligo OPALIN | 218834 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Group_bootstrapping_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.95293 | 0.109368 | 0.16 | 0.98 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Group_aggregate_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.95293 | 0.109368 | 0.16 | 0.98 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
| Group_correlation_coefficient | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.534097 | 0.149004 | -0.0336 | 0.4339 | 0.5431 | 0.6506 | 0.8607 |
| Cluster_label | 1355089 | 1323 | Marmoset-87 | 106820 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Cluster_name | 1355089 | 1323 | Marmoset-87 | 106820 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Cluster_alias | 1355089 | 1323 | Marmoset-87 | 106820 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Cluster_bootstrapping_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.877485 | 0.163927 | 0.14 | 0.8 | 0.96 | 1.0 | 1.0 |
| Cluster_aggregate_probability | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.877485 | 0.163927 | 0.14 | 0.8 | 0.96 | 1.0 | 1.0 |
| Cluster_correlation_coefficient | 1355089.0 | NaN | NaN | NaN | 0.534121 | 0.148903 | -0.0336 | 0.4339 | 0.5431 | 0.6505 | 0.8607 |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| genomic_resource.yaml | 740.0 B | c7810c7d3bbc8c691f2fb494508222a1 |
| mmc_results.csv.gz | 36.77 MB | ebdd0cc4f62695344a5574b9102b104a |
| statistics/ |