Resource
| Id | summary/johansen2025Crossspecies/supplementary_table/S1.2/consensus_anno_pre-print |
|---|---|
| Type | data_frame |
| Version | 0 |
| Summary |
Consensus taxonomy hierarchy and Group short names. - consensus_anno_pre-print
|
| Description |
nan |
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Group | 61 | 61 | STRd D1 Matrix MSN | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| accession_group | 61 | 61 | CS20250428_GROUP_0049 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| short_name_group | 61 | 61 | STRd D1 Matrix | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| embedding_set | 61 | 4 | Interneuron | 30 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| CL:ID:group | 58 | 42 | CL:0011005 | 10 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| spatial_regional_proportions | 61 | 40 | STR:1.0 | 7 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| spatial_proportions_marmoset | 56 | 36 | STR:1.0 | 9 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| spatial_proportions_macaque | 58 | 34 | STR:1.0 | 10 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| spatial_proportions_human | 60 | 34 | STR:0.9, Adj:0.1 | 7 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| spatial_description_manual | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| morphology_description | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| ephysiology_description | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| tf_marker_genes | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| combo_markers | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| binary_markers | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| curated_markers_to_primates | 6 | 6 | DRD1, STXBP6 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| curated_markers_to_mouse | 41 | 37 | DRD1 | 3 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| rationale_for_literature_link | 3 | 3 | Mapping to the arkypallidal neuron based on location (GPe) and characterized molecularly by expression of GAD1/2, FOXP2, MEIS2, and NPAS1 and lacks expression of canonical pallidal markers NKX2-1 and LHX6, SST and PV. | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| tokens_group | 61 | 61 | STRd|D1 Matrix MSN | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| display_order_group | 61.0 | NaN | NaN | NaN | 31.0 | 17.752934 | 1.0 | 16.0 | 31.0 | 46.0 | 61.0 |
| literature_support | 37 | 13 | Yao et al. 2023 | 11 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| literature_name_short | 20 | 19 | LAMP5 | 2 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| literature_name_long | 2 | 2 | D1 Islands of Calleja | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| neurotransmitter | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| color_hex_group | 61 | 61 | #1f77b4 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| color_group | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Subclass | 61 | 36 | STR D2 MSN | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| accession_subclass | 61 | 36 | CS20250428_SUBCL_0029 | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| CL:ID_subclass | 35 | 19 | CL:4023029 | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| tokens_subclass | 61 | 36 | STR|D2 MSN | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| display_order_subclass | 61.0 | NaN | NaN | NaN | 20.065574 | 10.321287 | 1.0 | 12.0 | 21.0 | 29.0 | 36.0 |
| color_hex_subclass | 61 | 36 | #253c8c | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| color_subclass | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Class | 61 | 12 | CN LGE GABA | 11 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| embedding_set.1 | 61 | 4 | Interneuron | 30 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| accession_class | 61 | 12 | CS20250428_CLASS_0003 | 11 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| CL:ID_class | 20 | 8 | CL:0000095 | 5 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| tokens_class | 61 | 12 | CN|LGE|GABA | 11 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| display_order_class | 61.0 | NaN | NaN | NaN | 6.770492 | 3.062643 | 1.0 | 4.0 | 7.0 | 9.0 | 12.0 |
| color_hex_class | 61 | 12 | #d0b83c | 11 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| color_class | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Neighborhood | 61 | 4 | Subpallium GABA | 37 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| accession_neighborhood | 61 | 4 | CS20250428_NEIGH_0002 | 37 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| CL:ID_neighborhood | 19 | 2 | CL:0000000 | 15 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| tokens_neighborhood | 61 | 4 | Subpallium|GABA | 37 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Unnamed: 45 | 61.0 | NaN | NaN | NaN | 2.360656 | 0.913469 | 1.0 | 1.0 | 3.0 | 3.0 | 4.0 |
| color_hex_neighborhood | 61 | 4 | #19613b | 37 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| color_neighborhood | 0.0 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| Supplemental Table S1.2.xlsx | 116.88 KB | 9be105f6a07cc4e07f4e07640ba1d2f3 |
| genomic_resource.yaml | 395.0 B | 9ce4728c75745b5ea03c7decdd14ed3f |
| statistics/ |