Resource

Id summary/liu2026Multiomics/supplementary_table/S1content_copy

Type data_frame

Version 0

Summary

Description

Labels

assay: SHARE-seq
dataset: liu2026Multiomics
reference_genome: reference/Human/genome/ucsc-hg38
sequencing_platform: Illumina
species: human
vendor: unknown

Columns	count	unique	top	freq	mean	std	min	25%	50%	75%	max
sample	76	76	T014_b11_Heart_PCW18	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
exp_batch	76.0	NaN	NaN	NaN	12.592105	4.333367	4.0	10.0	12.0	16.0	22.0
exp_barcode_row	76	12	F	10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
tissue_storage_code	76.0	75.0	136.0	2.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
organ	76	13	Lung	15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
organ_code	76	13	LU	15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
tissue_PCW	76.0	NaN	NaN	NaN	18.144737	2.779467	10.0	17.0	18.0	20.0	23.0
tissue_bioID	76.0	NaN	NaN	NaN	12.368421	5.630493	1.0	9.0	11.0	17.0	23.0
tissue_sex	76	2	F	42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
exp_run_date	76	12	2025-12-07 00:00:00	8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
cutoff_rna_nUMIs	76.0	NaN	NaN	NaN	1158.552632	399.532073	700.0	1000.0	1000.0	1225.0	2000.0
cutoff_rna_nGenes	76.0	NaN	NaN	NaN	542.105263	127.815657	500.0	500.0	500.0	500.0	1000.0
cutoff_rna_pctMT	76.0	NaN	NaN	NaN	20.0	0.0	20.0	20.0	20.0	20.0	20.0
cutoff_atac_TSS	76.0	NaN	NaN	NaN	5.697368	0.864403	5.0	5.0	5.0	7.0	7.0
cutoff_atac_nFrags	76.0	NaN	NaN	NaN	1598.684211	621.931062	1000.0	1000.0	1500.0	2000.0	3000.0
cutoff_nFrags_nUMIs_ratio	76.0	NaN	NaN	NaN	0.092105	0.405878	0.0	0.0	0.0	0.0	2.0
nCells	76.0	NaN	NaN	NaN	10759.736842	6132.233299	112.0	6446.25	10229.5	14433.75	24830.0
median_rna_nGenes	76.0	NaN	NaN	NaN	1588.355263	544.843083	868.0	1221.75	1416.5	1879.5	3525.0
median_rna_nUMIs	76.0	NaN	NaN	NaN	2578.75	1641.669476	1133.0	1587.0	1951.0	2990.125	9910.5
median_rna_pctMT	76.0	NaN	NaN	NaN	0.003747	0.012206	0.0	0.0	0.0	0.0	0.086244
median_atac_TSS	76.0	NaN	NaN	NaN	9.664204	2.040738	6.4295	7.843875	9.47325	11.26825	14.103
median_atac_nFrags	76.0	NaN	NaN	NaN	6206.881579	3013.076473	2276.0	4233.25	5413.5	7424.0	19986.0
median_atac_frip	76.0	NaN	NaN	NaN	0.367986	0.111255	0.186239	0.283462	0.337691	0.461358	0.595807

Files

Filename	Size	md5
S1.xlsx	14.14 KB	617b3b54091cf9a53a82dc15afd303c6
genomic_resource.yaml	5.25 KB	b66cf9fe16524390baf6683f5dd0e264
liu2026Multiomics-supplentary-tables.xlsx	2.85 MB	dee44d2161e40186b958cbdde847e435
statistics/