Resource
| Id | summary/liu2026Multiomics/supplementary_table/S2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Type | data_frame | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Version | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Summary |
Cluster annotations and QC metrics, related to Fig. 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cluster | 203 | 203 | LI_13 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| organ | 203 | 12 | Eye | 22 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| organ_code | 203 | 12 | EY | 22 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| cluster_id | 203.0 | NaN | NaN | NaN | 8.428571 | 5.598671 | 0.0 | 4.0 | 8.0 | 13.0 | 21.0 |
| compartment | 203 | 4 | epi | 79 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| L1_annot | 203 | 203 | LI_13_cholangiocyte | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| L2_annot | 203 | 134 | Brain excitatory neurons | 8 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| L3_annot | 203 | 37 | fibroblasts | 24 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| dend_order | 203.0 | NaN | NaN | NaN | 102.0 | 58.745213 | 1.0 | 51.5 | 102.0 | 152.5 | 203.0 |
| ncell | 203.0 | NaN | NaN | NaN | 4028.275862 | 4689.280484 | 25.0 | 965.5 | 2660.0 | 5595.0 | 33620.0 |
| median_numi | 203.0 | NaN | NaN | NaN | 2914.007389 | 1917.521095 | 877.0 | 1742.0 | 2297.0 | 3383.75 | 12916.0 |
| median_ngene | 203.0 | NaN | NaN | NaN | 1761.921182 | 664.749514 | 690.5 | 1290.5 | 1567.5 | 2143.75 | 4536.0 |
| median_nfrags | 203.0 | NaN | NaN | NaN | 7010.389163 | 3391.098553 | 1581.0 | 4483.25 | 6221.0 | 9077.75 | 20768.5 |
| median_tss | 203.0 | NaN | NaN | NaN | 9.180724 | 1.735068 | 6.2295 | 8.039 | 8.9465 | 10.121 | 16.468 |
| median_frip | 203.0 | NaN | NaN | NaN | 0.335284 | 0.092777 | 0.169153 | 0.26875 | 0.313053 | 0.379597 | 0.611671 |
| note | 203 | 174 | TPO, TG, TSHR+ | 6 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| organ_color | 203 | 12 | #ff9f0f | 22 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| compartment_color | 203 | 4 | #11A579 | 79 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| Cluster_ChromBPNet | 203 | 203 | Liver_c13 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| S2.xlsx | 31.27 KB | 3ff4e09b245f728fdd0a38ae99dff204 |
| genomic_resource.yaml | 2.35 KB | ab65f7daf7ed0e8cc5f818049e1dec8e |
| liu2026Multiomics-supplentary-tables.xlsx | 2.85 MB | dee44d2161e40186b958cbdde847e435 |
| statistics/ |