Resource
| Id | summary/zemke2023Conserved/supplementary_table/S2/macaque_v_marmoset |
|---|---|
| Type | data_frame |
| Version | 0 |
| Summary |
Pairwise differential gene expression. - macaque_v_marmoset
|
| Description |
N/A
|
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| index | 14069 | 14069 | SPIN4 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| logFC_ASC | 11223.0 | NaN | NaN | NaN | 0.027109 | 1.329905 | -9.712504 | -0.559809 | 0.00092 | 0.572941 | 8.667118 |
| FDR_ASC | 11223.0 | NaN | NaN | NaN | 0.299142 | 0.324379 | 0.0 | 0.005941 | 0.154965 | 0.563729 | 1.0 |
| logFC_ChC | 6397.0 | NaN | NaN | NaN | -0.071537 | 1.258288 | -9.332509 | -0.556981 | -0.026945 | 0.476586 | 10.030584 |
| FDR_ChC | 6397.0 | NaN | NaN | NaN | 0.400016 | 0.339835 | 0.0 | 0.054019 | 0.349421 | 0.717463 | 1.0 |
| logFC_Endo | 6891.0 | NaN | NaN | NaN | -0.063774 | 1.362722 | -10.212378 | -0.656266 | -0.028442 | 0.548445 | 8.097121 |
| FDR_Endo | 6891.0 | NaN | NaN | NaN | 0.419245 | 0.337582 | 0.0 | 0.077736 | 0.393696 | 0.731132 | 1.0 |
| logFC_L2_3_IT | 13672.0 | NaN | NaN | NaN | 0.063693 | 1.641529 | -14.431407 | -0.60073 | -0.003808 | 0.621728 | 11.772057 |
| FDR_L2_3_IT | 13672.0 | NaN | NaN | NaN | 0.265228 | 0.320506 | 0.0 | 0.000508 | 0.091356 | 0.496883 | 1.0 |
| logFC_L4_5_IT | 12930.0 | NaN | NaN | NaN | 0.068733 | 1.602259 | -11.048478 | -0.564798 | 0.032456 | 0.633126 | 10.487299 |
| FDR_L4_5_IT | 12930.0 | NaN | NaN | NaN | 0.258423 | 0.313904 | 0.0 | 0.00074 | 0.089009 | 0.484069 | 1.0 |
| logFC_L5_6_NP | 10724.0 | NaN | NaN | NaN | -0.052463 | 1.370536 | -9.600609 | -0.602456 | -0.039212 | 0.490447 | 9.929428 |
| FDR_L5_6_NP | 10724.0 | NaN | NaN | NaN | 0.304205 | 0.324185 | 0.0 | 0.006265 | 0.172102 | 0.561733 | 1.0 |
| logFC_L5_ET | 11980.0 | NaN | NaN | NaN | 0.033189 | 1.484656 | -11.33227 | -0.57168 | 0.008504 | 0.571219 | 11.442035 |
| FDR_L5_ET | 11980.0 | NaN | NaN | NaN | 0.240682 | 0.308142 | 0.0 | 0.000502 | 0.069182 | 0.434576 | 1.0 |
| logFC_L5_IT | 12534.0 | NaN | NaN | NaN | 0.063803 | 1.56611 | -12.641379 | -0.558129 | 0.013699 | 0.595431 | 10.213492 |
| FDR_L5_IT | 12534.0 | NaN | NaN | NaN | 0.253332 | 0.312571 | 0.0 | 0.000494 | 0.082152 | 0.468193 | 1.0 |
| logFC_L6b | 11107.0 | NaN | NaN | NaN | 0.017724 | 1.431303 | -11.125026 | -0.571542 | -0.00232 | 0.570741 | 8.902355 |
| FDR_L6b | 11107.0 | NaN | NaN | NaN | 0.310207 | 0.330898 | 0.0 | 0.006429 | 0.170025 | 0.592364 | 1.0 |
| logFC_L6_CT | 12022.0 | NaN | NaN | NaN | -0.011387 | 1.539448 | -12.578768 | -0.611853 | -0.014336 | 0.555448 | 9.817496 |
| FDR_L6_CT | 12022.0 | NaN | NaN | NaN | 0.264132 | 0.314151 | 0.0 | 0.001182 | 0.103585 | 0.495696 | 1.0 |
| logFC_L6_IT_CAR3 | 9091.0 | NaN | NaN | NaN | -0.002648 | 1.346133 | -8.805583 | -0.61596 | -0.018335 | 0.558508 | 10.98958 |
| FDR_L6_IT_CAR3 | 9091.0 | NaN | NaN | NaN | 0.351294 | 0.331837 | 0.0 | 0.027596 | 0.25813 | 0.637271 | 1.0 |
| logFC_L6_IT | 12181.0 | NaN | NaN | NaN | -0.022304 | 1.572494 | -11.859955 | -0.649076 | -0.033897 | 0.5511 | 11.097253 |
| FDR_L6_IT | 12181.0 | NaN | NaN | NaN | 0.232463 | 0.303062 | 0.0 | 0.000243 | 0.058494 | 0.416755 | 1.0 |
| logFC_LAMP5 | 10925.0 | NaN | NaN | NaN | 0.009821 | 1.373093 | -11.13621 | -0.559995 | 0.012988 | 0.558579 | 11.077503 |
| FDR_LAMP5 | 10925.0 | NaN | NaN | NaN | 0.302465 | 0.325675 | 0.0 | 0.006449 | 0.162036 | 0.565767 | 1.0 |
| logFC_MGC | 9910.0 | NaN | NaN | NaN | 0.01547 | 1.556546 | -11.525153 | -0.654941 | 0.017672 | 0.66481 | 11.446362 |
| FDR_MGC | 9910.0 | NaN | NaN | NaN | 0.268866 | 0.317409 | 0.0 | 0.001736 | 0.105899 | 0.500766 | 1.0 |
| logFC_ODC | 11932.0 | NaN | NaN | NaN | 0.05869 | 1.824013 | -13.350814 | -0.655963 | 0.000584 | 0.717644 | 12.562198 |
| FDR_ODC | 11932.0 | NaN | NaN | NaN | 0.233836 | 0.309079 | 0.0 | 0.000077 | 0.049789 | 0.42455 | 1.0 |
| logFC_OPC | 9474.0 | NaN | NaN | NaN | -0.024871 | 1.2863 | -10.041138 | -0.541263 | 0.011241 | 0.519189 | 9.900503 |
| FDR_OPC | 9474.0 | NaN | NaN | NaN | 0.348655 | 0.334679 | 0.0 | 0.020543 | 0.249947 | 0.644091 | 1.0 |
| logFC_PVALB | 12013.0 | NaN | NaN | NaN | -0.02633 | 1.451564 | -10.510366 | -0.598475 | -0.021015 | 0.537091 | 9.627596 |
| FDR_PVALB | 12013.0 | NaN | NaN | NaN | 0.268987 | 0.316635 | 0.0 | 0.001227 | 0.108815 | 0.502248 | 1.0 |
| logFC_SNCG | 9655.0 | NaN | NaN | NaN | -0.013721 | 1.189383 | -10.130349 | -0.513588 | -0.006339 | 0.490276 | 9.640767 |
| FDR_SNCG | 9655.0 | NaN | NaN | NaN | 0.327744 | 0.32834 | 0.0 | 0.013146 | 0.215656 | 0.615777 | 1.0 |
| logFC_SST | 11696.0 | NaN | NaN | NaN | 0.029393 | 1.381126 | -11.16027 | -0.503101 | 0.011217 | 0.533919 | 9.379566 |
| FDR_SST | 11696.0 | NaN | NaN | NaN | 0.290783 | 0.322008 | 0.0 | 0.003484 | 0.149127 | 0.540537 | 1.0 |
| logFC_VIP | 10817.0 | NaN | NaN | NaN | 0.015133 | 1.332246 | -11.417011 | -0.498237 | 0.010697 | 0.526772 | 10.569405 |
| FDR_VIP | 10817.0 | NaN | NaN | NaN | 0.337338 | 0.333382 | 0.0 | 0.012575 | 0.230098 | 0.628248 | 1.0 |
| logFC_VLMC | 8550.0 | NaN | NaN | NaN | -0.035945 | 1.221976 | -8.961189 | -0.608953 | -0.025478 | 0.524932 | 7.895779 |
| FDR_VLMC | 8550.0 | NaN | NaN | NaN | 0.395909 | 0.333399 | 0.0 | 0.067653 | 0.342288 | 0.699408 | 1.0 |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| Supplementary_Table_2.xlsx | 36.43 MB | 23261018c3384145a9910f9143e2d29e |
| genomic_resource.yaml | 246.0 B | 5c70e6a0da390c1af726ff73f090a2f2 |
| statistics/ |