Resource
| Id | summary/zemke2023Conserved/supplementary_table/S2/macaque_v_mouse |
|---|---|
| Type | data_frame |
| Version | 0 |
| Summary |
Pairwise differential gene expression. - macaque_v_mouse
|
| Description |
N/A
|
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| index | 14069 | 14069 | NKAIN3 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| logFC_ASC | 11223.0 | NaN | NaN | NaN | 0.194604 | 1.839709 | -10.439877 | -0.81523 | 0.060639 | 1.079502 | 10.222189 |
| FDR_ASC | 11223.0 | NaN | NaN | NaN | 0.174497 | 0.277051 | 0.0 | 0.000006 | 0.010457 | 0.257818 | 1.0 |
| logFC_ChC | 6397.0 | NaN | NaN | NaN | 0.214591 | 1.782169 | -10.538157 | -0.66116 | 0.120642 | 0.960063 | 10.43909 |
| FDR_ChC | 6397.0 | NaN | NaN | NaN | 0.309517 | 0.324621 | 0.0 | 0.01044 | 0.181097 | 0.571422 | 1.0 |
| logFC_Endo | 6891.0 | NaN | NaN | NaN | 0.213064 | 1.828982 | -11.480698 | -0.635462 | 0.1769 | 1.041446 | 12.362919 |
| FDR_Endo | 6891.0 | NaN | NaN | NaN | 0.366077 | 0.334563 | 0.0 | 0.035084 | 0.288114 | 0.668849 | 1.0 |
| logFC_L2_3_IT | 13672.0 | NaN | NaN | NaN | 0.22591 | 2.114641 | -12.195883 | -0.859107 | 0.044633 | 1.082534 | 13.604939 |
| FDR_L2_3_IT | 13672.0 | NaN | NaN | NaN | 0.155229 | 0.264296 | 0.0 | 0.0 | 0.003411 | 0.205149 | 1.0 |
| logFC_L4_5_IT | 12930.0 | NaN | NaN | NaN | 0.259646 | 2.098161 | -14.691645 | -0.812125 | 0.078786 | 1.08691 | 12.05566 |
| FDR_L4_5_IT | 12930.0 | NaN | NaN | NaN | 0.154227 | 0.264752 | 0.0 | 0.0 | 0.003391 | 0.189288 | 1.0 |
| logFC_L5_6_NP | 10724.0 | NaN | NaN | NaN | 0.208536 | 1.876912 | -11.8412 | -0.763638 | 0.050218 | 0.947722 | 10.320497 |
| FDR_L5_6_NP | 10724.0 | NaN | NaN | NaN | 0.197661 | 0.291557 | 0.0 | 0.000023 | 0.020443 | 0.317935 | 1.0 |
| logFC_L5_ET | 11980.0 | NaN | NaN | NaN | 0.254223 | 1.929503 | -12.317259 | -0.772571 | 0.070025 | 1.021389 | 10.939492 |
| FDR_L5_ET | 11980.0 | NaN | NaN | NaN | 0.146307 | 0.263051 | 0.0 | 0.0 | 0.002118 | 0.152137 | 1.0 |
| logFC_L5_IT | 12534.0 | NaN | NaN | NaN | 0.222721 | 2.055574 | -14.572709 | -0.808862 | 0.065252 | 1.030209 | 12.060774 |
| FDR_L5_IT | 12534.0 | NaN | NaN | NaN | 0.151174 | 0.262974 | 0.0 | 0.0 | 0.002784 | 0.180495 | 1.0 |
| logFC_L6b | 11107.0 | NaN | NaN | NaN | 0.26112 | 1.919142 | -12.374624 | -0.705719 | 0.097632 | 0.994541 | 10.969922 |
| FDR_L6b | 11107.0 | NaN | NaN | NaN | 0.223708 | 0.300749 | 0.0 | 0.000242 | 0.046402 | 0.397925 | 1.0 |
| logFC_L6_CT | 12022.0 | NaN | NaN | NaN | 0.191953 | 2.027474 | -13.287213 | -0.83707 | 0.012093 | 0.988819 | 11.832934 |
| FDR_L6_CT | 12022.0 | NaN | NaN | NaN | 0.168358 | 0.275939 | 0.0 | 0.0 | 0.005842 | 0.229085 | 1.0 |
| logFC_L6_IT_CAR3 | 9091.0 | NaN | NaN | NaN | 0.162572 | 1.750641 | -11.416244 | -0.726264 | 0.060299 | 0.8863 | 12.005143 |
| FDR_L6_IT_CAR3 | 9091.0 | NaN | NaN | NaN | 0.259598 | 0.31349 | 0.0 | 0.001993 | 0.092802 | 0.482527 | 1.0 |
| logFC_L6_IT | 12181.0 | NaN | NaN | NaN | 0.15316 | 2.052532 | -13.601753 | -0.866931 | 0.006246 | 0.949514 | 12.214832 |
| FDR_L6_IT | 12181.0 | NaN | NaN | NaN | 0.152719 | 0.264765 | 0.0 | 0.0 | 0.002878 | 0.18317 | 1.0 |
| logFC_LAMP5 | 10925.0 | NaN | NaN | NaN | 0.24905 | 1.902443 | -13.651479 | -0.71632 | 0.096757 | 0.977183 | 11.384142 |
| FDR_LAMP5 | 10925.0 | NaN | NaN | NaN | 0.197397 | 0.286594 | 0.0 | 0.000027 | 0.025013 | 0.325539 | 1.0 |
| logFC_MGC | 9910.0 | NaN | NaN | NaN | 0.267087 | 1.927578 | -10.06536 | -0.76504 | 0.104498 | 1.093284 | 12.397639 |
| FDR_MGC | 9910.0 | NaN | NaN | NaN | 0.185638 | 0.283061 | 0.0 | 0.000017 | 0.015188 | 0.284371 | 1.0 |
| logFC_ODC | 11932.0 | NaN | NaN | NaN | 0.377533 | 2.417591 | -11.73341 | -0.77972 | 0.158008 | 1.271161 | 14.904973 |
| FDR_ODC | 11932.0 | NaN | NaN | NaN | 0.172259 | 0.276604 | 0.0 | 0.000001 | 0.007544 | 0.251795 | 1.0 |
| logFC_OPC | 9474.0 | NaN | NaN | NaN | 0.135016 | 1.762849 | -10.73308 | -0.738436 | 0.083781 | 0.93593 | 10.722494 |
| FDR_OPC | 9474.0 | NaN | NaN | NaN | 0.243086 | 0.30445 | 0.0 | 0.001058 | 0.077571 | 0.436993 | 1.0 |
| logFC_PVALB | 12013.0 | NaN | NaN | NaN | 0.291859 | 2.016723 | -12.991563 | -0.753035 | 0.08399 | 1.038813 | 11.471634 |
| FDR_PVALB | 12013.0 | NaN | NaN | NaN | 0.174461 | 0.279227 | 0.0 | 0.000001 | 0.007867 | 0.255975 | 1.0 |
| logFC_SNCG | 9655.0 | NaN | NaN | NaN | 0.190545 | 1.667144 | -12.31691 | -0.678294 | 0.048995 | 0.86473 | 10.597452 |
| FDR_SNCG | 9655.0 | NaN | NaN | NaN | 0.21945 | 0.295182 | 0.0 | 0.000329 | 0.049563 | 0.372553 | 1.0 |
| logFC_SST | 11696.0 | NaN | NaN | NaN | 0.272192 | 1.917257 | -13.975686 | -0.701528 | 0.076087 | 0.961043 | 12.443002 |
| FDR_SST | 11696.0 | NaN | NaN | NaN | 0.179778 | 0.27932 | 0.0 | 0.000008 | 0.013807 | 0.268269 | 1.0 |
| logFC_VIP | 10817.0 | NaN | NaN | NaN | 0.239785 | 1.87402 | -13.044503 | -0.683973 | 0.091892 | 0.915293 | 10.645684 |
| FDR_VIP | 10817.0 | NaN | NaN | NaN | 0.220546 | 0.297781 | 0.0 | 0.000241 | 0.049784 | 0.377532 | 1.0 |
| logFC_VLMC | 8550.0 | NaN | NaN | NaN | 0.06771 | 1.715059 | -9.884313 | -0.858478 | -0.006187 | 0.943842 | 12.110786 |
| FDR_VLMC | 8550.0 | NaN | NaN | NaN | 0.228573 | 0.299485 | 0.0 | 0.000658 | 0.058545 | 0.402353 | 1.0 |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| Supplementary_Table_2.xlsx | 36.43 MB | 23261018c3384145a9910f9143e2d29e |
| genomic_resource.yaml | 240.0 B | b55a8255c85cd8c128d396ff0cf4da19 |
| statistics/ |