Resource
| Id | summary/zemke2023Conserved/supplementary_table/S2/marmoset_v_mouse |
|---|---|
| Type | data_frame |
| Version | 0 |
| Summary |
Pairwise differential gene expression. - marmoset_v_mouse
|
| Description |
N/A
|
| Labels |
|
| Columns | count | unique | top | freq | mean | std | min | 25% | 50% | 75% | max |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| index | 14069 | 14069 | FAM20A | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| logFC_ASC | 11223.0 | NaN | NaN | NaN | 0.167495 | 1.886994 | -10.069264 | -0.844504 | 0.050429 | 1.062906 | 10.696745 |
| FDR_ASC | 11223.0 | NaN | NaN | NaN | 0.149862 | 0.26236 | 0.0 | 0.0 | 0.002817 | 0.173752 | 1.0 |
| logFC_ChC | 6397.0 | NaN | NaN | NaN | 0.286128 | 1.770467 | -10.538157 | -0.590664 | 0.152802 | 0.934342 | 11.456405 |
| FDR_ChC | 6397.0 | NaN | NaN | NaN | 0.293599 | 0.320254 | 0.0 | 0.005052 | 0.160424 | 0.547618 | 1.0 |
| logFC_Endo | 6891.0 | NaN | NaN | NaN | 0.276838 | 1.832675 | -9.46752 | -0.658736 | 0.185067 | 1.074827 | 10.212378 |
| FDR_Endo | 6891.0 | NaN | NaN | NaN | 0.318806 | 0.327817 | 0.0 | 0.014286 | 0.193478 | 0.597268 | 1.0 |
| logFC_L2_3_IT | 13672.0 | NaN | NaN | NaN | 0.162217 | 2.128986 | -12.813566 | -0.866071 | 0.0266 | 1.032534 | 13.529649 |
| FDR_L2_3_IT | 13672.0 | NaN | NaN | NaN | 0.153035 | 0.264917 | 0.0 | 0.0 | 0.002005 | 0.192815 | 1.0 |
| logFC_L4_5_IT | 12930.0 | NaN | NaN | NaN | 0.190912 | 2.077571 | -12.643164 | -0.817535 | 0.044222 | 1.030564 | 13.008567 |
| FDR_L4_5_IT | 12930.0 | NaN | NaN | NaN | 0.147006 | 0.261128 | 0.0 | 0.0 | 0.001878 | 0.164701 | 1.0 |
| logFC_L5_6_NP | 10724.0 | NaN | NaN | NaN | 0.260999 | 1.85415 | -11.8412 | -0.67958 | 0.085784 | 0.95956 | 10.497816 |
| FDR_L5_6_NP | 10724.0 | NaN | NaN | NaN | 0.179833 | 0.279353 | 0.0 | 0.000004 | 0.010999 | 0.283679 | 1.0 |
| logFC_L5_ET | 11980.0 | NaN | NaN | NaN | 0.221034 | 1.928368 | -12.417486 | -0.752619 | 0.05099 | 0.986941 | 11.33227 |
| FDR_L5_ET | 11980.0 | NaN | NaN | NaN | 0.141078 | 0.259031 | 0.0 | 0.0 | 0.000914 | 0.150548 | 1.0 |
| logFC_L5_IT | 12534.0 | NaN | NaN | NaN | 0.158917 | 2.076644 | -12.614021 | -0.813889 | 0.042539 | 0.974621 | 12.641379 |
| FDR_L5_IT | 12534.0 | NaN | NaN | NaN | 0.143892 | 0.256996 | 0.0 | 0.0 | 0.001652 | 0.163714 | 1.0 |
| logFC_L6b | 11107.0 | NaN | NaN | NaN | 0.243396 | 1.889142 | -11.039074 | -0.680079 | 0.097392 | 0.975468 | 11.872168 |
| FDR_L6b | 11107.0 | NaN | NaN | NaN | 0.222881 | 0.301623 | 0.0 | 0.000266 | 0.045162 | 0.38992 | 1.0 |
| logFC_L6_CT | 12022.0 | NaN | NaN | NaN | 0.203339 | 2.021731 | -13.287213 | -0.799167 | 0.023083 | 0.979574 | 12.578768 |
| FDR_L6_CT | 12022.0 | NaN | NaN | NaN | 0.159904 | 0.270544 | 0.0 | 0.0 | 0.00344 | 0.201011 | 1.0 |
| logFC_L6_IT_CAR3 | 9091.0 | NaN | NaN | NaN | 0.16522 | 1.763971 | -10.318507 | -0.674636 | 0.07639 | 0.875368 | 11.13953 |
| FDR_L6_IT_CAR3 | 9091.0 | NaN | NaN | NaN | 0.261751 | 0.313939 | 0.0 | 0.001836 | 0.10103 | 0.478013 | 1.0 |
| logFC_L6_IT | 12181.0 | NaN | NaN | NaN | 0.175464 | 2.059406 | -12.35515 | -0.801365 | 0.026841 | 0.96152 | 11.859955 |
| FDR_L6_IT | 12181.0 | NaN | NaN | NaN | 0.148098 | 0.263438 | 0.0 | 0.0 | 0.0019 | 0.169904 | 1.0 |
| logFC_LAMP5 | 10925.0 | NaN | NaN | NaN | 0.239228 | 1.926742 | -11.748713 | -0.740443 | 0.057426 | 0.966713 | 11.238745 |
| FDR_LAMP5 | 10925.0 | NaN | NaN | NaN | 0.194436 | 0.290481 | 0.0 | 0.000019 | 0.019694 | 0.306069 | 1.0 |
| logFC_MGC | 9910.0 | NaN | NaN | NaN | 0.251617 | 2.041767 | -10.631885 | -0.81315 | 0.085669 | 1.085637 | 12.083294 |
| FDR_MGC | 9910.0 | NaN | NaN | NaN | 0.173804 | 0.278358 | 0.0 | 0.000003 | 0.009997 | 0.248792 | 1.0 |
| logFC_ODC | 11932.0 | NaN | NaN | NaN | 0.318843 | 2.472145 | -12.756148 | -0.795547 | 0.140477 | 1.194228 | 16.389393 |
| FDR_ODC | 11932.0 | NaN | NaN | NaN | 0.168079 | 0.275169 | 0.0 | 0.0 | 0.006682 | 0.238248 | 1.0 |
| logFC_OPC | 9474.0 | NaN | NaN | NaN | 0.159887 | 1.741932 | -9.854724 | -0.707342 | 0.069211 | 0.885732 | 11.450732 |
| FDR_OPC | 9474.0 | NaN | NaN | NaN | 0.2399 | 0.304707 | 0.0 | 0.00086 | 0.069153 | 0.429442 | 1.0 |
| logFC_PVALB | 12013.0 | NaN | NaN | NaN | 0.318189 | 2.029907 | -12.991563 | -0.69417 | 0.089219 | 1.044668 | 11.935049 |
| FDR_PVALB | 12013.0 | NaN | NaN | NaN | 0.166752 | 0.274652 | 0.0 | 0.0 | 0.005315 | 0.232369 | 1.0 |
| logFC_SNCG | 9655.0 | NaN | NaN | NaN | 0.204265 | 1.662926 | -12.31691 | -0.631457 | 0.079502 | 0.835861 | 11.32578 |
| FDR_SNCG | 9655.0 | NaN | NaN | NaN | 0.218856 | 0.297567 | 0.0 | 0.000168 | 0.042053 | 0.39359 | 1.0 |
| logFC_SST | 11696.0 | NaN | NaN | NaN | 0.242799 | 1.922378 | -13.975686 | -0.691594 | 0.054456 | 0.918242 | 10.993268 |
| FDR_SST | 11696.0 | NaN | NaN | NaN | 0.17742 | 0.279121 | 0.0 | 0.000004 | 0.011156 | 0.264362 | 1.0 |
| logFC_VIP | 10817.0 | NaN | NaN | NaN | 0.224651 | 1.869543 | -10.869265 | -0.667055 | 0.07885 | 0.882349 | 12.338563 |
| FDR_VIP | 10817.0 | NaN | NaN | NaN | 0.222515 | 0.300078 | 0.0 | 0.000225 | 0.047078 | 0.392993 | 1.0 |
| logFC_VLMC | 8550.0 | NaN | NaN | NaN | 0.103655 | 1.692569 | -11.095998 | -0.827952 | -0.010108 | 0.928617 | 9.646409 |
| FDR_VLMC | 8550.0 | NaN | NaN | NaN | 0.192671 | 0.285039 | 0.0 | 0.000052 | 0.021408 | 0.308454 | 1.0 |
Files
| Filename | Size | md5 |
|---|---|---|
| Supplementary_Table_2.xlsx | 36.43 MB | 23261018c3384145a9910f9143e2d29e |
| genomic_resource.yaml | 242.0 B | 4289d5922ba319c5d46cfc4e829ea7ce |
| statistics/ |