Resource

Id summary/zemke2024Epigenetic/supplementary_table/S21content_copy
Type data_frame
Version 0
Summary
Description
Labels
  • assay: 10x_Multiome
  • brain_region: hippocampus
  • dataset: zemke2024Epigenetic
  • reference_genome: reference/Human/genome/ucsc-hg38
  • sequencing_platform: Illumina
  • species: human
  • vendor: 10x_Genomics
Columns count unique top freq mean std min 25% 50% 75% max
Motif Name 880 439 RORgt(NR)/EL4-RORgt.Flag-ChIP-Seq(GSE56019)/Homer 4 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
Consensus 880 431 AACCGGAAGT 4 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
P-value 880.0 NaN NaN NaN 0.7662 0.407102 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0
Log P-value 880.0 NaN NaN NaN -2.207608 4.633308 -48.17 -2.29825 -0.85615 -0.25705 -0.0
q-value (Benjamini) 880.0 NaN NaN NaN 0.705674 0.347773 0.0 0.4079 0.8914 1.0 1.0
# of Target Sequences with Motif(of 796) 880.0 NaN NaN NaN 248.398864 266.5451 0.0 56.75 157.0 341.0 1637.0
% of Target Sequences with Motif 880 571 2.14% 7 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
# of Background Sequences with Motif(of 94474) 880.0 NaN NaN NaN 16346.593182 14760.691678 53.1 4592.6 12531.35 23450.15 78988.7
% of Background Sequences with Motif 880 788 1.31% 4 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
Primed_state_correlated 880 2 Primed_state_correlated 440 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN

Files

Filename Size md5
Table_S21.tsv.gz 35.67 KB 653ac5062779d2472deb30ef938848f1
genomic_resource.yaml 351.0 B 4d6782c1fd1c0413fdf5ca07b5d8c5e0
statistics/