Resource

Id	summary/zemke2024Epigenetic/supplementary_table/S9content_copy
Type	data_frame
Version	0
Summary
Description
Labels	assay: 10x_Multiome brain_region: hippocampus dataset: zemke2024Epigenetic reference_genome: reference/Human/genome/ucsc-hg38 sequencing_platform: Illumina species: human vendor: 10x_Genomics

Columns	count	unique	top	freq	mean	std	min	25%	50%	75%	max
Motif Name	3520	439	RORgt(NR)/EL4-RORgt.Flag-ChIP-Seq(GSE56019)/Homer	16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
Consensus	3520	431	CCWGGAATGY	16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
P-value	3520.0	NaN	NaN	NaN	0.818606	0.37271	0.0	1.0	1.0	1.0	1.0
Log P-value	3520.0	NaN	NaN	NaN	-2.272084	7.276134	-105.9	-1.7935	-0.5789	-0.137075	0.0
q-value (Benjamini)	3520.0	NaN	NaN	NaN	0.80233	0.324038	0.0	0.71455	1.0	1.0	1.0
# of Target Sequences with Motif(of 1154)	3520.0	NaN	NaN	NaN	127.321875	217.164815	0.0	15.0	47.0	139.0	2635.0
% of Target Sequences with Motif	3520	1223	0.00%	76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
# of Background Sequences with Motif(of 108843)	3520.0	NaN	NaN	NaN	7768.474545	8290.323025	7.6	1816.7	5054.95	10635.675	62339.1
% of Background Sequences with Motif	3520	1622	1.14%	13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
Celltype_Direction	3520	8	Astro_cCREs_up_with_age	440	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN

Files